冷凍干機在生物工程、醫藥工業、食品工業、材料科學和農副產品深加工等領域有著廣泛的應用。藥品冷凍干機包括西藥和中藥兩部分。西藥冷凍干燥在國內已經得到了一定的發展，很多較大型的制藥廠都有冷凍干機設備。在針劑方面，冷凍干機工藝采用的比較多，提高了藥品質量和貯存期限，給醫患雙方都帶來了利益。但目前凍干藥品的品種不多，產品價格高，干燥工藝不先進。在中藥方面，目前還只局限在人參、鹿茸、山藥、冬蟲夏草等少量中藥材的凍干，大量的中成藥還沒有采用凍干工藝，與國外差距較大。日本幾年前就開展了“漢藥西制”，改變了中藥的熬制方法，解決了中藥不能制成針劑或片劑的傳統，也解決了中藥不治急病的難題，因此我國中藥凍干工藝及產品的研究很有潛力可挖。在生物技術產品領域，凍干技術主要用于血清、血漿、疫苗、酶、抗生素、激素等藥品的生產；生物化學的檢查藥品、免疫學及細菌學的檢查藥品；血液、細菌、動脈、骨骼、皮膚、角膜、神經組織及各種器官長期保存等。
　　
　　 凍干機相對常規方法，凍干法具有如下優點：
　　
　　 *許多熱敏性的物質不會發生變性或失活。
　　
　　 *在低溫下干燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小。
　　
　　 *在凍干過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的性狀。
　　
　　 *由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。
　　
　　 *由于物料中水分在預凍以后以冰晶的形態存在，原來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中。升華時，溶于水中的溶解物質就析出，避免了一般干燥方法中因物料內部水分向表面遷移所攜帶的無機鹽在表面析出而造成表面硬化的現象。
　　
　　 *干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速而*，幾乎立即恢復原來的性狀。
　　
　　 *由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。
　　
　　 *干燥能排除95%～99%以上的水分，使干燥后產品能長期保存而不致變質。
　　
　　 *因物料處于凍結狀態，溫度很低，所以供熱的熱源溫度要求不高，采用常溫或溫度不高的加熱器即可滿足要求。如果冷凍室和干燥室分開時，干燥室不需絕熱，不會有很多的熱損失，故熱能的利用很經濟。